Celebró enlace con Doña Tomasa Ladrón de Guevara (hija del Maestre de Campo Don Pedro Ladrón de Guevara, natural de Mendoza, y de Doña Josefa Núñez Pinazo,
Fueron sus hijos: Don Pedro Pablo de Ceballos y Nis, fallecido en Totoralejo en 1775 y casado con doña María Josefa de Bustos y Guevara, nacida en 1738 y dotada en la estancia del Rosario (Punilla) el 15.Vlll.1755, hija legítima del capitán Pedro Bustos de Albomoz y doña Tomasa Ladrón de Guevara (E. 3-27-18). Padres de: A. Don José Lino de Ceballos, nacido en 1756 y fallecido sin sucesión. B. Doña María lsabel de Ceballos, nacida en ...
Obtuvo una merced de tierras en el Rio Segundo y dejó una sola hija de su matrimonio con doña Tomasa Ladrón de Guevara.