Casó con Beatriz de Villena (1483 - 1535), hija de Álvaro de Braganza, hermano del duque Fernando II de Braganza, y de Felipa de Melo, condesa de Olivenza. Tuvieron numerosos hijos, con el sobrenombre "de Lancastre":
Juan (1501 - 22 de agosto de 1571. Primer duque de Aveiro, hidalgo de la Casa Real, embajador en la corte de Castilla y Marqués de Torres Novas en 1547;
Luis (¿? - 1574), Gran Comandante de la Orden de Avis (puesto hereditario, transmitido a los jefes de família entre sus descendientes). Casó en 1540 con Magdalena Téllez Giron o de Granada;
Jaime (¿? - ¿?), sacerdote;
Elena (¿? - ¿?), monja;
Felipa (¿? - ¿?), monja;
Maria (¿? - ¿?), monja;
Isabel (¿? - ¿?), monja;
Alfonso (¿? - 1578), que se casó con Violante Henriques y Coutinho.