En 1503, el conde se casó con Juana Enríquez, la Virgen de la Vega y Ruy Ponce, quien murió ese mismo año. En 1504 se casó por segunda vez con Juana de Cabrera y Bobadilla, hija de Andrés de Cabrera, primero marqués de Moya, con quien tuvo tres hijos. En 1506 se casó por tercera vez con María de Luna y Bobadilla, hija de Álvaro de Luna, segundo Señor de Fuentidueña.
Por Juana de Cabrera:
Pedro Fernández Manrique, cuarto conde de Osorno (1504-1569)
Alonso Manrique de Lara
Juan Manrique
Por María de Luna:
María Magdalena Manrique, se casó con Andrés Hurtado de Mendoza, 3ro marqués de Cañete
Diego Hurtado de Mendoza, cuarto marqués de Cañete
García Hurtado de Mendoza, quinto marqués de Cañete
Isabel de Luna
Árbol Completo
